Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

Predictions only

Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
ATRQ13535 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ATRQ13535 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ATRQ13535 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ATRQ13535 HNRNPA1P5-201ENST00000558213 966 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
ATRQ13535 NAT9-204ENST00000578822 839 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ATRQ13535 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ATRQ13535 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ATRQ13535 AL513478.2-202ENST00000621949 835 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ATRQ13535 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ATRQ13535 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ATRQ13535 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ATRQ13535 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ATRQ13535 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ATRQ13535 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ATRQ13535 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ATRQ13535 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ATRQ13535 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ATRQ13535 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ATRQ13535 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ATRQ13535 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ATRQ13535 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ATRQ13535 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ATRQ13535 HTR3D-201ENST00000334128 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ATRQ13535 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
ATRQ13535 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
ATRQ13535 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
ATRQ13535 AC099567.1-201ENST00000414418 931 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ATRQ13535 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ATRQ13535 AAMDC-210ENST00000532481 690 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ATRQ13535 BMF-206ENST00000558774 671 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ATRQ13535 INO80E-209ENST00000567254 625 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ATRQ13535 MYMX-201ENST00000573382 817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ATRQ13535 MIR4746-201ENST00000579802 71 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
ATRQ13535 AC091588.3-201ENST00000583442 770 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ATRQ13535 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ATRQ13535 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ATRQ13535 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ATRQ13535 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ATRQ13535 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ATRQ13535 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ATRQ13535 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ATRQ13535 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ATRQ13535 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ATRQ13535 UBE2L5P-202ENST00000635918 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ATRQ13535 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ATRQ13535 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ATRQ13535 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ATRQ13535 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ATRQ13535 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ATRQ13535 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ATRQ13535 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ATRQ13535 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ATRQ13535 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ATRQ13535 TAMM41-201ENST00000273037 1297 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ATRQ13535 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ATRQ13535 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ATRQ13535 SNRPCP15-201ENST00000424055 192 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
ATRQ13535 IFNWP2-201ENST00000431203 580 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
ATRQ13535 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ATRQ13535 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ATRQ13535 KRT8P34-201ENST00000577607 1044 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
ATRQ13535 AC022001.3-201ENST00000606330 596 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
ATRQ13535 AC079331.1-201ENST00000623200 1200 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
ATRQ13535 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ATRQ13535 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ATRQ13535 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ATRQ13535 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ATRQ13535 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ATRQ13535 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ATRQ13535 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ATRQ13535 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ATRQ13535 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ATRQ13535 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ATRQ13535 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ATRQ13535 IL18BP-201ENST00000260049 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ATRQ13535 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ATRQ13535 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ATRQ13535 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
ATRQ13535 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ATRQ13535 PDE4DIP-202ENST00000369347 1137 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ATRQ13535 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ATRQ13535 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ATRQ13535 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ATRQ13535 CAP2-207ENST00000493172 861 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ATRQ13535 AP000920.1-201ENST00000531824 344 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
ATRQ13535 GLT8D2-204ENST00000547583 862 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ATRQ13535 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
ATRQ13535 Z82244.2-201ENST00000632196 448 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
ATRQ13535 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ATRQ13535 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ATRQ13535 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ATRQ13535 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ATRQ13535 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ATRQ13535 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ATRQ13535 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ATRQ13535 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ATRQ13535 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ATRQ13535 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ATRQ13535 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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