Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 ACTR3C-201ENST00000252071 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 AC087276.2-201ENST00000394183 183 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 CDK7P1-201ENST00000434574 693 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 HNRNPA3P12-201ENST00000437410 1063 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 BTF3L4-204ENST00000484036 941 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 RPS3A-204ENST00000506126 862 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 AP000755.1-201ENST00000527100 507 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 AC125611.1-201ENST00000549563 229 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 AC234775.3-201ENST00000564612 656 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 AC007342.1-201ENST00000565073 706 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 SAMD9L-209ENST00000610760 1221 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 MFAP3L-202ENST00000393702 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 CCL20-202ENST00000409189 839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 AC004231.1-201ENST00000418393 815 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 TMPRSS11GP-201ENST00000431070 1204 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 AP000959.1-201ENST00000441759 977 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 AC018523.2-201ENST00000555531 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 ZNF761-205ENST00000613950 646 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 AC026336.4-201ENST00000624565 1050 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 AC073857.1-201ENST00000625082 1054 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
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