Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 CSHL1-201ENST00000259003 739 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 CSHL1-206ENST00000450719 973 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 TREX1-203ENST00000456089 629 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 TBC1D3P6-201ENST00000505954 962 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 TRAPPC2L-212ENST00000567312 499 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 MED11-202ENST00000573708 802 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 LINC01869-204ENST00000635639 1047 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 CHRNA2-201ENST00000240132 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 TPPP3-205ENST00000564104 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 SFXN4-201ENST00000355697 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 HCRTR1-201ENST00000373705 1170 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 AC112250.1-201ENST00000504640 745 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 BMF-206ENST00000558774 671 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 LINC01029-202ENST00000578833 366 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 AC093503.1-201ENST00000593888 495 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 ZNF175-204ENST00000596504 580 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 AC026120.2-201ENST00000617239 309 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 MEFV-203ENST00000536379 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 AC008536.3-201ENST00000623282 1599 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 HIGD2A-201ENST00000274787 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 DHRS7C-201ENST00000330255 1006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 KRT18P33-201ENST00000398525 1043 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 RPL18AP16-201ENST00000424057 531 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 TPP1-209ENST00000528657 578 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 KRT8P34-201ENST00000577607 1044 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 Metazoa_SRP.75-201ENST00000614439 293 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 FAM226B-201ENST00000602508 1490 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 AC098657.1-201ENST00000416270 1135 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 ARSEP1-202ENST00000430152 499 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 TONSL-AS1-201ENST00000442850 428 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 AC087741.1-204ENST00000573935 646 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 NNMT-203ENST00000535401 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 HTD2-205ENST00000477305 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 HNRNPA1P21-201ENST00000424115 961 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 AC092756.1-201ENST00000560248 448 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 KRT17P4-203ENST00000579355 621 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 AP005899.1-201ENST00000579467 544 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 AL353997.6-201ENST00000583394 621 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRDM2Q13029 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
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