Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GBE1Q04446 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms