Protein–RNA interactions for Protein: Q02297

NRG1, Pro-neuregulin-1, membrane-bound isoform, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRG1Q02297 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NRG1Q02297 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms