Protein–RNA interactions for Protein: P86452

ZBED6, Zinc finger BED domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED6P86452 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZBED6P86452 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZBED6P86452 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZBED6P86452 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZBED6P86452 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZBED6P86452 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZBED6P86452 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZBED6P86452 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZBED6P86452 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZBED6P86452 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZBED6P86452 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZBED6P86452 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZBED6P86452 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZBED6P86452 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZBED6P86452 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZBED6P86452 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZBED6P86452 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZBED6P86452 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZBED6P86452 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZBED6P86452 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZBED6P86452 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZBED6P86452 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZBED6P86452 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZBED6P86452 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZBED6P86452 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZBED6P86452 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZBED6P86452 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZBED6P86452 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZBED6P86452 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZBED6P86452 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZBED6P86452 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZBED6P86452 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZBED6P86452 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZBED6P86452 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZBED6P86452 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZBED6P86452 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZBED6P86452 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZBED6P86452 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZBED6P86452 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ZBED6P86452 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZBED6P86452 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ZBED6P86452 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ZBED6P86452 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZBED6P86452 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ZBED6P86452 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ZBED6P86452 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZBED6P86452 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ZBED6P86452 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZBED6P86452 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZBED6P86452 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZBED6P86452 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZBED6P86452 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZBED6P86452 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZBED6P86452 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZBED6P86452 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZBED6P86452 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZBED6P86452 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZBED6P86452 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ZBED6P86452 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ZBED6P86452 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ZBED6P86452 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ZBED6P86452 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ZBED6P86452 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ZBED6P86452 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ZBED6P86452 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ZBED6P86452 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ZBED6P86452 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ZBED6P86452 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZBED6P86452 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZBED6P86452 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZBED6P86452 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZBED6P86452 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZBED6P86452 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ZBED6P86452 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZBED6P86452 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZBED6P86452 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZBED6P86452 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZBED6P86452 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZBED6P86452 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZBED6P86452 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZBED6P86452 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZBED6P86452 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZBED6P86452 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZBED6P86452 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZBED6P86452 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZBED6P86452 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZBED6P86452 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZBED6P86452 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZBED6P86452 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZBED6P86452 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZBED6P86452 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ZBED6P86452 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZBED6P86452 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZBED6P86452 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ZBED6P86452 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZBED6P86452 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZBED6P86452 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZBED6P86452 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ZBED6P86452 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZBED6P86452 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms