Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 NHP2P1-201ENST00000335274 462 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 AC090001.1-201ENST00000553194 467 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 SRP14-204ENST00000558720 780 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 AC012506.1-201ENST00000423706 525 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 RBM4-207ENST00000506523 654 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 2127.7 ms