Protein–RNA interactions for Protein: P56915

GSC, Homeobox protein goosecoid, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSCP56915 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GSCP56915 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GSCP56915 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GSCP56915 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GSCP56915 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GSCP56915 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GSCP56915 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GSCP56915 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GSCP56915 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GSCP56915 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GSCP56915 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GSCP56915 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GSCP56915 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GSCP56915 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GSCP56915 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GSCP56915 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GSCP56915 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GSCP56915 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GSCP56915 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GSCP56915 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GSCP56915 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GSCP56915 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GSCP56915 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GSCP56915 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GSCP56915 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GSCP56915 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GSCP56915 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GSCP56915 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GSCP56915 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GSCP56915 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GSCP56915 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GSCP56915 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GSCP56915 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GSCP56915 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GSCP56915 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GSCP56915 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GSCP56915 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GSCP56915 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GSCP56915 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GSCP56915 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GSCP56915 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GSCP56915 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GSCP56915 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GSCP56915 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSCP56915 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSCP56915 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSCP56915 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSCP56915 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSCP56915 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSCP56915 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSCP56915 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSCP56915 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSCP56915 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSCP56915 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSCP56915 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSCP56915 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSCP56915 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSCP56915 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSCP56915 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSCP56915 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSCP56915 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSCP56915 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSCP56915 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSCP56915 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSCP56915 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSCP56915 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GSCP56915 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSCP56915 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSCP56915 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSCP56915 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GSCP56915 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GSCP56915 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GSCP56915 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSCP56915 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSCP56915 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSCP56915 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSCP56915 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GSCP56915 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSCP56915 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSCP56915 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSCP56915 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSCP56915 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSCP56915 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSCP56915 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSCP56915 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSCP56915 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSCP56915 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSCP56915 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSCP56915 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSCP56915 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSCP56915 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSCP56915 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSCP56915 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSCP56915 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSCP56915 EXOC3-201ENST00000315013 2682 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSCP56915 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSCP56915 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSCP56915 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSCP56915 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSCP56915 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms