Protein–RNA interactions for Protein: P56746

CLDN15, Claudin-15, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN15P56746 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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CLDN15P56746 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
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CLDN15P56746 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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CLDN15P56746 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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CLDN15P56746 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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CLDN15P56746 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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CLDN15P56746 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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CLDN15P56746 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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CLDN15P56746 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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CLDN15P56746 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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CLDN15P56746 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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CLDN15P56746 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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CLDN15P56746 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
CLDN15P56746 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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