Protein–RNA interactions for Protein: P56524

HDAC4, Histone deacetylase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC4P56524 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC4P56524 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms