Protein–RNA interactions for Protein: P52294

KPNA1, Importin subunit alpha-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA1P52294 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KPNA1P52294 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KPNA1P52294 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KPNA1P52294 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KPNA1P52294 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KPNA1P52294 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KPNA1P52294 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KPNA1P52294 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KPNA1P52294 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KPNA1P52294 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KPNA1P52294 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KPNA1P52294 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KPNA1P52294 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KPNA1P52294 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KPNA1P52294 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KPNA1P52294 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KPNA1P52294 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KPNA1P52294 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KPNA1P52294 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms