Protein–RNA interactions for Protein: P51159

RAB27A, Ras-related protein Rab-27A, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB27AP51159 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB27AP51159 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB27AP51159 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB27AP51159 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB27AP51159 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB27AP51159 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB27AP51159 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB27AP51159 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB27AP51159 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB27AP51159 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB27AP51159 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RAB27AP51159 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB27AP51159 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB27AP51159 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB27AP51159 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB27AP51159 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB27AP51159 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB27AP51159 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB27AP51159 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB27AP51159 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB27AP51159 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB27AP51159 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB27AP51159 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB27AP51159 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB27AP51159 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB27AP51159 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RAB27AP51159 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB27AP51159 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB27AP51159 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RAB27AP51159 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB27AP51159 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB27AP51159 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RAB27AP51159 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB27AP51159 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RAB27AP51159 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB27AP51159 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB27AP51159 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RAB27AP51159 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB27AP51159 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB27AP51159 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB27AP51159 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB27AP51159 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB27AP51159 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB27AP51159 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB27AP51159 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB27AP51159 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB27AP51159 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB27AP51159 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB27AP51159 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB27AP51159 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB27AP51159 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RAB27AP51159 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB27AP51159 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB27AP51159 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB27AP51159 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB27AP51159 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB27AP51159 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB27AP51159 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB27AP51159 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB27AP51159 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB27AP51159 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB27AP51159 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB27AP51159 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB27AP51159 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB27AP51159 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RAB27AP51159 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RAB27AP51159 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB27AP51159 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB27AP51159 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB27AP51159 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB27AP51159 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB27AP51159 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB27AP51159 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB27AP51159 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB27AP51159 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB27AP51159 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB27AP51159 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB27AP51159 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB27AP51159 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB27AP51159 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB27AP51159 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB27AP51159 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB27AP51159 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB27AP51159 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB27AP51159 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB27AP51159 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB27AP51159 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB27AP51159 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB27AP51159 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB27AP51159 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB27AP51159 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB27AP51159 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB27AP51159 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB27AP51159 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB27AP51159 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB27AP51159 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB27AP51159 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB27AP51159 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB27AP51159 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB27AP51159 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms