Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP4P49662 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP4P49662 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP4P49662 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP4P49662 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP4P49662 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP4P49662 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP4P49662 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP4P49662 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP4P49662 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP4P49662 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP4P49662 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP4P49662 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP4P49662 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP4P49662 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP4P49662 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP4P49662 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP4P49662 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP4P49662 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP4P49662 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP4P49662 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP4P49662 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP4P49662 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP4P49662 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP4P49662 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP4P49662 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP4P49662 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP4P49662 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP4P49662 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP4P49662 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP4P49662 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP4P49662 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP4P49662 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP4P49662 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP4P49662 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP4P49662 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP4P49662 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP4P49662 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP4P49662 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP4P49662 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP4P49662 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP4P49662 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP4P49662 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP4P49662 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP4P49662 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP4P49662 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP4P49662 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP4P49662 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP4P49662 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP4P49662 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP4P49662 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP4P49662 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP4P49662 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP4P49662 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP4P49662 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP4P49662 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP4P49662 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP4P49662 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP4P49662 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP4P49662 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP4P49662 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP4P49662 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP4P49662 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP4P49662 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP4P49662 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP4P49662 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP4P49662 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP4P49662 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP4P49662 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP4P49662 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP4P49662 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP4P49662 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP4P49662 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP4P49662 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP4P49662 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP4P49662 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP4P49662 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP4P49662 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP4P49662 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP4P49662 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP4P49662 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP4P49662 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP4P49662 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP4P49662 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP4P49662 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP4P49662 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP4P49662 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP4P49662 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP4P49662 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP4P49662 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP4P49662 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP4P49662 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP4P49662 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP4P49662 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP4P49662 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP4P49662 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP4P49662 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP4P49662 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP4P49662 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP4P49662 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms