Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACADSBP45954 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms