Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms