Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP5DP30049 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP5DP30049 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms