Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
CD40LGP29965 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CD40LGP29965 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CD40LGP29965 NFATC1-204ENST00000397790 3453 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CD40LGP29965 RGL4-202ENST00000401461 2420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CD40LGP29965 MATN1-AS1-201ENST00000414532 3925 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CD40LGP29965 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CD40LGP29965 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CD40LGP29965 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CD40LGP29965 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CD40LGP29965 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CD40LGP29965 AMER2-201ENST00000357816 10055 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CD40LGP29965 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CD40LGP29965 STRA6-222ENST00000616000 2843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CD40LGP29965 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CD40LGP29965 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CD40LGP29965 GOLGA7B-203ENST00000596005 6378 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CD40LGP29965 FLAD1-207ENST00000368433 2656 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 MYRIP-203ENST00000425621 2981 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 FBRSL1-205ENST00000542061 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 SEC23A-201ENST00000307712 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 TJAP1-204ENST00000372449 2695 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 SIX1-203ENST00000554986 1959 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 TRPM5-202ENST00000528453 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 EML5-207ENST00000554922 9570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 VILL-201ENST00000283713 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 HTR5A-201ENST00000287907 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 CDC20B-203ENST00000381375 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 ABCB7-203ENST00000373394 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CD40LGP29965 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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