Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRKCHP24723 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms