Protein–RNA interactions for Protein: P22528

SPRR1B, Cornifin-B, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRR1BP22528 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC8.86□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8.85□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC8.85□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
SPRR1BP22528 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms