Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRAP18433 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRAP18433 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRAP18433 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRAP18433 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRAP18433 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRAP18433 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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PTPRAP18433 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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PTPRAP18433 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRAP18433 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRAP18433 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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PTPRAP18433 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
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PTPRAP18433 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
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PTPRAP18433 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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PTPRAP18433 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRAP18433 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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PTPRAP18433 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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PTPRAP18433 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRAP18433 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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PTPRAP18433 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRAP18433 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRAP18433 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRAP18433 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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