Protein–RNA interactions for Protein: P17405

SMPD1, Sphingomyelin phosphodiesterase, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD1P17405 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SMPD1P17405 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SMPD1P17405 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SMPD1P17405 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SMPD1P17405 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SMPD1P17405 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SMPD1P17405 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMPD1P17405 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMPD1P17405 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMPD1P17405 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMPD1P17405 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMPD1P17405 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMPD1P17405 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMPD1P17405 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMPD1P17405 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMPD1P17405 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMPD1P17405 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMPD1P17405 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMPD1P17405 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMPD1P17405 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMPD1P17405 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMPD1P17405 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMPD1P17405 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMPD1P17405 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SMPD1P17405 IL12A-202ENST00000466512 1283 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMPD1P17405 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMPD1P17405 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMPD1P17405 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SMPD1P17405 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMPD1P17405 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMPD1P17405 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMPD1P17405 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMPD1P17405 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMPD1P17405 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMPD1P17405 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMPD1P17405 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMPD1P17405 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMPD1P17405 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMPD1P17405 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMPD1P17405 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMPD1P17405 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMPD1P17405 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMPD1P17405 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMPD1P17405 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMPD1P17405 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMPD1P17405 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMPD1P17405 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMPD1P17405 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMPD1P17405 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMPD1P17405 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMPD1P17405 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMPD1P17405 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMPD1P17405 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms