Protein–RNA interactions for Protein: P13994

CCDC130, Coiled-coil domain-containing protein 130, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC130P13994 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC130P13994 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC130P13994 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC130P13994 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC130P13994 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC130P13994 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC130P13994 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC130P13994 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC130P13994 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC130P13994 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC130P13994 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC130P13994 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC130P13994 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC130P13994 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC130P13994 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC130P13994 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC130P13994 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC130P13994 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC130P13994 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC130P13994 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC130P13994 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC130P13994 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC130P13994 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC130P13994 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC130P13994 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC130P13994 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC130P13994 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC130P13994 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC130P13994 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC130P13994 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC130P13994 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC130P13994 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC130P13994 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC130P13994 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC130P13994 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC130P13994 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC130P13994 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC130P13994 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC130P13994 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC130P13994 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC130P13994 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC130P13994 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC130P13994 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC130P13994 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC130P13994 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC130P13994 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC130P13994 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC130P13994 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC130P13994 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC130P13994 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC130P13994 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC130P13994 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC130P13994 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC130P13994 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC130P13994 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC130P13994 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC130P13994 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC130P13994 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC130P13994 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC130P13994 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC130P13994 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC130P13994 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC130P13994 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC130P13994 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC130P13994 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC130P13994 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC130P13994 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC130P13994 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC130P13994 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC130P13994 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC130P13994 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC130P13994 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC130P13994 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC130P13994 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC130P13994 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC130P13994 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC130P13994 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC130P13994 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC130P13994 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC130P13994 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC130P13994 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC130P13994 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC130P13994 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC130P13994 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC130P13994 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC130P13994 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC130P13994 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC130P13994 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC130P13994 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC130P13994 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC130P13994 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC130P13994 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC130P13994 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC130P13994 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC130P13994 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC130P13994 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC130P13994 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC130P13994 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC130P13994 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC130P13994 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms