Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 HIST1H1D-201ENST00000244534 666 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 G0S2-201ENST00000367029 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 KCNK16-204ENST00000437525 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 AL451000.1-201ENST00000451300 1186 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 NMNAT3-213ENST00000512391 794 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 SCGB1B2P-201ENST00000595013 612 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 PSMA6-215ENST00000622405 978 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 HPGD-201ENST00000296521 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 HIST1H4B-201ENST00000377745 438 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 AC012506.1-201ENST00000423706 525 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 AL049840.2-201ENST00000602722 535 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 CLEC20A-202ENST00000623247 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 LAMP5-202ENST00000427562 1309 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 AC099567.1-201ENST00000414418 931 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 AC147651.3-201ENST00000429872 731 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 CES1P2-201ENST00000566467 1242 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 METTL6-202ENST00000383790 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 OR10N1P-201ENST00000392758 869 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 HLA-DPA2-205ENST00000433582 733 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 C20orf96-202ENST00000382369 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 IFNLR1-204ENST00000374419 953 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 ABCD1P4-201ENST00000399687 604 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 NAA60-205ENST00000424546 1149 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 RPL3P5-201ENST00000441645 1232 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 HKR1-220ENST00000591259 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 AC017033.1-201ENST00000603720 708 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 MKRN2-202ENST00000411987 1436 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms