Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGAVP06756 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms