Protein–RNA interactions for Protein: P00736

C1R, Complement C1r subcomponent, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1RP00736 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1RP00736 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1RP00736 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1RP00736 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1RP00736 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1RP00736 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1RP00736 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1RP00736 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1RP00736 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1RP00736 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1RP00736 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1RP00736 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1RP00736 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1RP00736 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1RP00736 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1RP00736 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1RP00736 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
C1RP00736 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
C1RP00736 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1RP00736 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1RP00736 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1RP00736 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
C1RP00736 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1RP00736 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1RP00736 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1RP00736 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
C1RP00736 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1RP00736 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1RP00736 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1RP00736 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1RP00736 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1RP00736 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1RP00736 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1RP00736 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1RP00736 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1RP00736 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1RP00736 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1RP00736 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1RP00736 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1RP00736 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1RP00736 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
C1RP00736 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1RP00736 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1RP00736 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1RP00736 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1RP00736 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1RP00736 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1RP00736 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1RP00736 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1RP00736 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1RP00736 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1RP00736 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1RP00736 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1RP00736 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1RP00736 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1RP00736 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C1RP00736 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1RP00736 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1RP00736 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1RP00736 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1RP00736 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1RP00736 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1RP00736 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C1RP00736 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1RP00736 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1RP00736 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1RP00736 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C1RP00736 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1RP00736 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1RP00736 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1RP00736 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1RP00736 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C1RP00736 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C1RP00736 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1RP00736 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C1RP00736 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1RP00736 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1RP00736 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1RP00736 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1RP00736 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1RP00736 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1RP00736 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1RP00736 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1RP00736 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1RP00736 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1RP00736 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1RP00736 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1RP00736 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1RP00736 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1RP00736 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1RP00736 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1RP00736 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1RP00736 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1RP00736 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1RP00736 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1RP00736 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1RP00736 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1RP00736 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1RP00736 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1RP00736 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms