Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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HOXA3O43365 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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HOXA3O43365 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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HOXA3O43365 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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HOXA3O43365 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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HOXA3O43365 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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HOXA3O43365 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC11.9□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
HOXA3O43365 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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