Protein–RNA interactions for Protein: O15178

T, Brachyury protein, humanhuman

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Length 435 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TO15178 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TO15178 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TO15178 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TO15178 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
TO15178 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TO15178 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TO15178 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TO15178 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TO15178 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TO15178 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TO15178 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TO15178 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TO15178 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
TO15178 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TO15178 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TO15178 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TO15178 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
TO15178 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TO15178 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TO15178 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TO15178 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TO15178 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TO15178 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TO15178 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
TO15178 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TO15178 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TO15178 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TO15178 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TO15178 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TO15178 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TO15178 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
TO15178 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TO15178 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TO15178 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TO15178 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TO15178 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TO15178 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TO15178 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TO15178 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TO15178 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TO15178 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TO15178 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TO15178 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TO15178 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TO15178 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TO15178 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TO15178 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TO15178 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TO15178 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TO15178 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TO15178 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TO15178 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TO15178 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TO15178 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TO15178 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TO15178 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TO15178 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TO15178 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TO15178 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TO15178 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TO15178 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TO15178 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TO15178 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TO15178 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TO15178 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TO15178 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TO15178 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TO15178 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TO15178 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
TO15178 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TO15178 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TO15178 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TO15178 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TO15178 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TO15178 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TO15178 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
TO15178 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TO15178 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TO15178 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TO15178 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TO15178 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TO15178 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TO15178 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TO15178 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TO15178 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TO15178 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
TO15178 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
TO15178 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
TO15178 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TO15178 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TO15178 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TO15178 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TO15178 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TO15178 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TO15178 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
TO15178 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TO15178 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TO15178 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
TO15178 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
TO15178 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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