Protein–RNA interactions for Protein: A8MV65

VGLL3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL3A8MV65 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 PAQR3-209ENST00000512733 9811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 ELOVL6-201ENST00000302274 3090 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 FBLN2-201ENST00000295760 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 MTHFSD-201ENST00000360900 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 JMJD7-PLA2G4B-201ENST00000342159 2966 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 AJAP1-202ENST00000378191 11666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 WDR41-201ENST00000296679 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 DIP2C-205ENST00000634311 4961 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 BRINP2-201ENST00000361539 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 NBN-203ENST00000409330 4523 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 POM121L6P-201ENST00000441186 1826 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 ZNF331-201ENST00000253144 5042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 ZNF621-201ENST00000310898 2404 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 TRPC7-203ENST00000502753 2424 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 ARHGEF33-201ENST00000398800 4300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 LIG1-221ENST00000613670 3949 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 LTF-201ENST00000231751 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 OTUD6B-206ENST00000617869 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 RNF216-205ENST00000425013 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 ETAA1-201ENST00000272342 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 GFAP-214ENST00000588735 6538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 SMG6-203ENST00000536871 1865 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 BEAN1-207ENST00000564819 2929 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 AL031714.1-201ENST00000567829 2926 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 Z98257.2-202ENST00000641138 1548 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 TXNRD1-214ENST00000526691 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 FAM131A-201ENST00000310585 3677 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 PLK4-209ENST00000513090 3123 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 ANKRD34B-201ENST00000338682 3938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 MAP7D2-202ENST00000379651 3930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 PPT2-EGFL8-202ENST00000422437 4181 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 SRP54-201ENST00000216774 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 UBTF-206ENST00000527034 3010 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 FSCN3-201ENST00000265825 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 OPRK1-201ENST00000265572 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 MAPK10-262ENST00000641051 5738 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 KIRREL1-201ENST00000359209 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 CDH4-201ENST00000543233 3117 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 PRAMEF25-201ENST00000614839 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 PRAMEF26-201ENST00000624207 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 HIF3A-204ENST00000300862 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 SMIM10L1-201ENST00000622602 4795 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VGLL3A8MV65 ACLY-204ENST00000537919 2974 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms