Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
KNCNA6PVL3 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms