Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC169A6NNP5 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms