Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms