Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 RPF1-201ENST00000370654 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 HLA-DRB5-201ENST00000374975 1260 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 MED7-202ENST00000420343 1382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 UBR5-AS1-202ENST00000520820 800 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 ENPP7P8-202ENST00000527856 1345 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 AL365181.1-201ENST00000564032 1828 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM192A-218ENST00000567439 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 RARS-210ENST00000626454 177 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 PCK2-208ENST00000559250 1804 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC50A1-203ENST00000368404 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF576-205ENST00000529930 830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 DLK1-205ENST00000556051 469 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 IGHV3OR15-7-201ENST00000558565 359 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 Metazoa_SRP.157-201ENST00000622819 262 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 AADAT-206ENST00000509167 2113 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 OR10N1P-201ENST00000392758 869 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 AC122719.1-201ENST00000507989 559 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 AC108471.2-201ENST00000533736 1061 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 APOC1-209ENST00000592885 562 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 ADAMTS9-AS1-216ENST00000626280 882 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 COQ4-201ENST00000300452 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAPPC8Q9Y2L5 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms