Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR5

SLC8A2, Sodium/calcium exchanger 2, humanhuman

Predictions only

Length 921 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A2Q9UPR5 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8A2Q9UPR5 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms