Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 WDFY2-203ENST00000612477 6932 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC11□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC11□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC11□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC11□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC11□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC11□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 PLXNB1-201ENST00000296440 7143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms