Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W0

IFNK, Interferon kappa, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNKQ9P0W0 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNKQ9P0W0 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNKQ9P0W0 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNKQ9P0W0 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNKQ9P0W0 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNKQ9P0W0 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNKQ9P0W0 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNKQ9P0W0 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNKQ9P0W0 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNKQ9P0W0 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNKQ9P0W0 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNKQ9P0W0 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNKQ9P0W0 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNKQ9P0W0 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNKQ9P0W0 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNKQ9P0W0 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNKQ9P0W0 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNKQ9P0W0 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNKQ9P0W0 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNKQ9P0W0 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNKQ9P0W0 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNKQ9P0W0 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNKQ9P0W0 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNKQ9P0W0 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNKQ9P0W0 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNKQ9P0W0 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNKQ9P0W0 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNKQ9P0W0 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNKQ9P0W0 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNKQ9P0W0 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNKQ9P0W0 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNKQ9P0W0 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNKQ9P0W0 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNKQ9P0W0 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNKQ9P0W0 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNKQ9P0W0 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNKQ9P0W0 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNKQ9P0W0 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNKQ9P0W0 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNKQ9P0W0 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNKQ9P0W0 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNKQ9P0W0 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNKQ9P0W0 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNKQ9P0W0 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNKQ9P0W0 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNKQ9P0W0 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNKQ9P0W0 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNKQ9P0W0 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNKQ9P0W0 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNKQ9P0W0 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNKQ9P0W0 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNKQ9P0W0 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNKQ9P0W0 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNKQ9P0W0 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNKQ9P0W0 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNKQ9P0W0 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNKQ9P0W0 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNKQ9P0W0 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNKQ9P0W0 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNKQ9P0W0 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNKQ9P0W0 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNKQ9P0W0 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNKQ9P0W0 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNKQ9P0W0 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNKQ9P0W0 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNKQ9P0W0 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNKQ9P0W0 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNKQ9P0W0 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNKQ9P0W0 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNKQ9P0W0 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNKQ9P0W0 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNKQ9P0W0 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNKQ9P0W0 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNKQ9P0W0 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNKQ9P0W0 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNKQ9P0W0 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNKQ9P0W0 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNKQ9P0W0 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNKQ9P0W0 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNKQ9P0W0 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNKQ9P0W0 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNKQ9P0W0 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNKQ9P0W0 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNKQ9P0W0 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNKQ9P0W0 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNKQ9P0W0 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNKQ9P0W0 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNKQ9P0W0 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNKQ9P0W0 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNKQ9P0W0 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNKQ9P0W0 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNKQ9P0W0 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNKQ9P0W0 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNKQ9P0W0 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNKQ9P0W0 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNKQ9P0W0 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNKQ9P0W0 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNKQ9P0W0 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNKQ9P0W0 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNKQ9P0W0 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms