Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
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SH3BP4Q9P0V3 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
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SH3BP4Q9P0V3 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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SH3BP4Q9P0V3 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
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