Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

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Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC14□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC14□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC14□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC14□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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VAPAQ9P0L0 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
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VAPAQ9P0L0 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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VAPAQ9P0L0 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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VAPAQ9P0L0 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
VAPAQ9P0L0 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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