Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG8

KCNK4, Potassium channel subfamily K member 4, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK4Q9NYG8 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNK4Q9NYG8 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNK4Q9NYG8 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNK4Q9NYG8 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KCNK4Q9NYG8 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNK4Q9NYG8 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNK4Q9NYG8 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KCNK4Q9NYG8 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KCNK4Q9NYG8 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNK4Q9NYG8 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNK4Q9NYG8 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
KCNK4Q9NYG8 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNK4Q9NYG8 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KCNK4Q9NYG8 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNK4Q9NYG8 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KCNK4Q9NYG8 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNK4Q9NYG8 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNK4Q9NYG8 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNK4Q9NYG8 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KCNK4Q9NYG8 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNK4Q9NYG8 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KCNK4Q9NYG8 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNK4Q9NYG8 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNK4Q9NYG8 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNK4Q9NYG8 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KCNK4Q9NYG8 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNK4Q9NYG8 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KCNK4Q9NYG8 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNK4Q9NYG8 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNK4Q9NYG8 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KCNK4Q9NYG8 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNK4Q9NYG8 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
KCNK4Q9NYG8 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNK4Q9NYG8 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KCNK4Q9NYG8 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNK4Q9NYG8 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNK4Q9NYG8 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNK4Q9NYG8 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNK4Q9NYG8 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
KCNK4Q9NYG8 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
KCNK4Q9NYG8 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNK4Q9NYG8 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KCNK4Q9NYG8 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KCNK4Q9NYG8 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KCNK4Q9NYG8 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNK4Q9NYG8 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
KCNK4Q9NYG8 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KCNK4Q9NYG8 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
KCNK4Q9NYG8 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
KCNK4Q9NYG8 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KCNK4Q9NYG8 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KCNK4Q9NYG8 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KCNK4Q9NYG8 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KCNK4Q9NYG8 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNK4Q9NYG8 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNK4Q9NYG8 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
KCNK4Q9NYG8 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNK4Q9NYG8 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNK4Q9NYG8 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KCNK4Q9NYG8 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNK4Q9NYG8 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNK4Q9NYG8 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNK4Q9NYG8 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KCNK4Q9NYG8 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KCNK4Q9NYG8 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNK4Q9NYG8 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KCNK4Q9NYG8 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
KCNK4Q9NYG8 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNK4Q9NYG8 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KCNK4Q9NYG8 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KCNK4Q9NYG8 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KCNK4Q9NYG8 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNK4Q9NYG8 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNK4Q9NYG8 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNK4Q9NYG8 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNK4Q9NYG8 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KCNK4Q9NYG8 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
KCNK4Q9NYG8 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KCNK4Q9NYG8 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
KCNK4Q9NYG8 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KCNK4Q9NYG8 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
KCNK4Q9NYG8 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KCNK4Q9NYG8 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KCNK4Q9NYG8 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
KCNK4Q9NYG8 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
KCNK4Q9NYG8 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
KCNK4Q9NYG8 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KCNK4Q9NYG8 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KCNK4Q9NYG8 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KCNK4Q9NYG8 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KCNK4Q9NYG8 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KCNK4Q9NYG8 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KCNK4Q9NYG8 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KCNK4Q9NYG8 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KCNK4Q9NYG8 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.02■□□□□ -0
KCNK4Q9NYG8 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KCNK4Q9NYG8 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.02■□□□□ -0
KCNK4Q9NYG8 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
KCNK4Q9NYG8 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.02■□□□□ -0
KCNK4Q9NYG8 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms