Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARFGAP3Q9NP61 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms