Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 SNX33-201ENST00000308527 8008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 UBFD1-207ENST00000567212 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 FAM212B-201ENST00000357260 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 TBX3-202ENST00000349155 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 SLC6A10P-201ENST00000330048 3846 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 EPB41L5-205ENST00000452780 6410 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC13□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 TNS1-207ENST00000430930 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 YWHAZ-206ENST00000395957 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC13□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC13□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC13□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC13□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC13□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC13□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC13□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC13□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC13□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC13□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 NUMA1-234ENST00000620566 7012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC13□□□□□ -0.33
ELL3Q9HB65 TNS1-205ENST00000419504 5921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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