Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 SIX3-AS1-201ENST00000419364 844 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 FOXP4-AS1-205ENST00000454812 575 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 SEPHS2P1-201ENST00000511618 1162 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 LZTS1-AS1-201ENST00000523103 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 CES1P2-201ENST00000566467 1242 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 COQ4-204ENST00000608951 781 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 KLHL7-204ENST00000410047 1233 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 IQCF4-202ENST00000422896 745 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 RNLS-203ENST00000437752 525 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 AC117945.1-201ENST00000451375 463 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 TMEM14B-208ENST00000467317 1224 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 RN7SL128P-201ENST00000467883 305 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 KLF3-AS1-203ENST00000504219 627 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 FAM192A-218ENST00000567439 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 VDAC2-202ENST00000313132 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 CLCC1-202ENST00000348264 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 TNNT1-202ENST00000356783 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 AC022080.1-201ENST00000366255 781 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 AP000354.1-201ENST00000396982 456 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 HNRNPA1P5-201ENST00000558213 966 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 RN7SL556P-201ENST00000582856 298 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 FAAP24-203ENST00000589646 836 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 PFDN5-220ENST00000628881 231 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 AL365181.1-201ENST00000564032 1828 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 GALP-201ENST00000357330 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 S100A13-203ENST00000392623 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 OR10N1P-201ENST00000392758 869 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 GALP-202ENST00000440823 889 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 AC138409.2-203ENST00000508395 553 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 LINC02252-201ENST00000565706 487 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 ZNF737-204ENST00000596797 569 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 AL136982.5-201ENST00000605222 294 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 PCK2-208ENST00000559250 1804 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 WASH7P-201ENST00000488147 1351 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NLRP1Q9C000 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms