Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIFKQ9BYG3 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms