Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY11

PACSIN1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN1Q9BY11 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PACSIN1Q9BY11 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms