Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SPOCK3Q9BQ16 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SPOCK3Q9BQ16 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
SPOCK3Q9BQ16 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
SPOCK3Q9BQ16 LINC01670-203ENST00000624859 977 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SPOCK3Q9BQ16 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SPOCK3Q9BQ16 OSBPL3-204ENST00000409069 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SPOCK3Q9BQ16 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SPOCK3Q9BQ16 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SPOCK3Q9BQ16 FAM214B-204ENST00000378566 2566 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SPOCK3Q9BQ16 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SPOCK3Q9BQ16 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SPOCK3Q9BQ16 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
SPOCK3Q9BQ16 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SPOCK3Q9BQ16 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
SPOCK3Q9BQ16 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
SPOCK3Q9BQ16 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SPOCK3Q9BQ16 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SPOCK3Q9BQ16 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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SPOCK3Q9BQ16 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SPOCK3Q9BQ16 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SPOCK3Q9BQ16 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SPOCK3Q9BQ16 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
SPOCK3Q9BQ16 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SPOCK3Q9BQ16 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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SPOCK3Q9BQ16 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SPOCK3Q9BQ16 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SPOCK3Q9BQ16 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SPOCK3Q9BQ16 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SPOCK3Q9BQ16 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SPOCK3Q9BQ16 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SPOCK3Q9BQ16 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
SPOCK3Q9BQ16 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SPOCK3Q9BQ16 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SPOCK3Q9BQ16 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SPOCK3Q9BQ16 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SPOCK3Q9BQ16 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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SPOCK3Q9BQ16 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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SPOCK3Q9BQ16 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SPOCK3Q9BQ16 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
SPOCK3Q9BQ16 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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SPOCK3Q9BQ16 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SPOCK3Q9BQ16 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SPOCK3Q9BQ16 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SPOCK3Q9BQ16 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SPOCK3Q9BQ16 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SPOCK3Q9BQ16 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SPOCK3Q9BQ16 AC009227.1-201ENST00000434635 2362 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SPOCK3Q9BQ16 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SPOCK3Q9BQ16 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SPOCK3Q9BQ16 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SPOCK3Q9BQ16 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SPOCK3Q9BQ16 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SPOCK3Q9BQ16 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SPOCK3Q9BQ16 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SPOCK3Q9BQ16 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SPOCK3Q9BQ16 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SPOCK3Q9BQ16 CYB561D1-206ENST00000496961 3424 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SPOCK3Q9BQ16 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SPOCK3Q9BQ16 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SPOCK3Q9BQ16 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SPOCK3Q9BQ16 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SPOCK3Q9BQ16 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SPOCK3Q9BQ16 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SPOCK3Q9BQ16 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SPOCK3Q9BQ16 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SPOCK3Q9BQ16 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
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