Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW8

NIPSNAP1, Protein NipSnap homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP1Q9BPW8 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms