Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SGCZQ96LD1 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SGCZQ96LD1 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SGCZQ96LD1 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SGCZQ96LD1 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SGCZQ96LD1 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SGCZQ96LD1 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SGCZQ96LD1 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SGCZQ96LD1 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SGCZQ96LD1 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SGCZQ96LD1 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SGCZQ96LD1 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SGCZQ96LD1 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SGCZQ96LD1 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SGCZQ96LD1 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SGCZQ96LD1 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SGCZQ96LD1 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SGCZQ96LD1 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SGCZQ96LD1 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SGCZQ96LD1 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SGCZQ96LD1 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SGCZQ96LD1 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SGCZQ96LD1 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SGCZQ96LD1 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SGCZQ96LD1 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SGCZQ96LD1 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SGCZQ96LD1 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SGCZQ96LD1 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SGCZQ96LD1 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SGCZQ96LD1 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SGCZQ96LD1 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SGCZQ96LD1 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SGCZQ96LD1 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SGCZQ96LD1 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SGCZQ96LD1 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SGCZQ96LD1 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SGCZQ96LD1 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SGCZQ96LD1 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SGCZQ96LD1 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SGCZQ96LD1 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SGCZQ96LD1 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SGCZQ96LD1 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SGCZQ96LD1 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SGCZQ96LD1 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
SGCZQ96LD1 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SGCZQ96LD1 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SGCZQ96LD1 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SGCZQ96LD1 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SGCZQ96LD1 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SGCZQ96LD1 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SGCZQ96LD1 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SGCZQ96LD1 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SGCZQ96LD1 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SGCZQ96LD1 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SGCZQ96LD1 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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