Protein–RNA interactions for Protein: Q969F2

NKD2, Protein naked cuticle homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD2Q969F2 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKD2Q969F2 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms