Protein–RNA interactions for Protein: Q92968

PEX13, Peroxisomal membrane protein PEX13, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX13Q92968 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PEX13Q92968 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PEX13Q92968 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PEX13Q92968 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PEX13Q92968 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PEX13Q92968 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PEX13Q92968 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PEX13Q92968 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PEX13Q92968 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PEX13Q92968 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PEX13Q92968 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PEX13Q92968 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PEX13Q92968 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PEX13Q92968 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PEX13Q92968 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PEX13Q92968 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PEX13Q92968 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PEX13Q92968 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PEX13Q92968 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PEX13Q92968 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PEX13Q92968 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PEX13Q92968 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PEX13Q92968 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PEX13Q92968 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PEX13Q92968 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PEX13Q92968 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PEX13Q92968 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PEX13Q92968 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PEX13Q92968 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PEX13Q92968 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PEX13Q92968 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PEX13Q92968 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PEX13Q92968 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PEX13Q92968 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PEX13Q92968 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PEX13Q92968 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PEX13Q92968 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PEX13Q92968 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PEX13Q92968 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PEX13Q92968 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PEX13Q92968 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PEX13Q92968 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PEX13Q92968 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PEX13Q92968 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PEX13Q92968 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PEX13Q92968 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PEX13Q92968 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PEX13Q92968 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PEX13Q92968 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PEX13Q92968 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PEX13Q92968 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PEX13Q92968 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PEX13Q92968 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PEX13Q92968 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PEX13Q92968 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PEX13Q92968 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PEX13Q92968 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PEX13Q92968 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PEX13Q92968 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PEX13Q92968 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PEX13Q92968 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PEX13Q92968 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PEX13Q92968 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PEX13Q92968 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PEX13Q92968 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PEX13Q92968 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PEX13Q92968 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PEX13Q92968 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PEX13Q92968 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PEX13Q92968 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PEX13Q92968 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PEX13Q92968 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PEX13Q92968 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PEX13Q92968 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PEX13Q92968 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PEX13Q92968 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PEX13Q92968 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PEX13Q92968 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PEX13Q92968 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PEX13Q92968 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PEX13Q92968 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PEX13Q92968 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PEX13Q92968 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PEX13Q92968 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PEX13Q92968 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PEX13Q92968 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PEX13Q92968 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PEX13Q92968 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PEX13Q92968 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PEX13Q92968 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PEX13Q92968 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PEX13Q92968 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PEX13Q92968 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PEX13Q92968 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PEX13Q92968 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PEX13Q92968 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PEX13Q92968 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PEX13Q92968 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PEX13Q92968 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PEX13Q92968 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms