Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ3

C9orf40, Uncharacterized protein C9orf40, humanhuman

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf40Q8IXQ3 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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C9orf40Q8IXQ3 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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C9orf40Q8IXQ3 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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C9orf40Q8IXQ3 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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C9orf40Q8IXQ3 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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C9orf40Q8IXQ3 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C9orf40Q8IXQ3 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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C9orf40Q8IXQ3 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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C9orf40Q8IXQ3 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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C9orf40Q8IXQ3 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C9orf40Q8IXQ3 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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C9orf40Q8IXQ3 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C9orf40Q8IXQ3 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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C9orf40Q8IXQ3 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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C9orf40Q8IXQ3 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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