Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU1

TCF23, Transcription factor 23, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF23Q7RTU1 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TCF23Q7RTU1 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TCF23Q7RTU1 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TCF23Q7RTU1 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TCF23Q7RTU1 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TCF23Q7RTU1 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TCF23Q7RTU1 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TCF23Q7RTU1 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TCF23Q7RTU1 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TCF23Q7RTU1 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TCF23Q7RTU1 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TCF23Q7RTU1 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TCF23Q7RTU1 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TCF23Q7RTU1 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TCF23Q7RTU1 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
TCF23Q7RTU1 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TCF23Q7RTU1 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TCF23Q7RTU1 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TCF23Q7RTU1 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TCF23Q7RTU1 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TCF23Q7RTU1 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TCF23Q7RTU1 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TCF23Q7RTU1 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
TCF23Q7RTU1 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TCF23Q7RTU1 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TCF23Q7RTU1 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TCF23Q7RTU1 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TCF23Q7RTU1 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TCF23Q7RTU1 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TCF23Q7RTU1 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TCF23Q7RTU1 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TCF23Q7RTU1 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TCF23Q7RTU1 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
TCF23Q7RTU1 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TCF23Q7RTU1 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TCF23Q7RTU1 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TCF23Q7RTU1 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TCF23Q7RTU1 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TCF23Q7RTU1 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TCF23Q7RTU1 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TCF23Q7RTU1 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TCF23Q7RTU1 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TCF23Q7RTU1 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TCF23Q7RTU1 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TCF23Q7RTU1 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TCF23Q7RTU1 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TCF23Q7RTU1 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
TCF23Q7RTU1 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TCF23Q7RTU1 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TCF23Q7RTU1 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
TCF23Q7RTU1 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TCF23Q7RTU1 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TCF23Q7RTU1 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TCF23Q7RTU1 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TCF23Q7RTU1 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TCF23Q7RTU1 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TCF23Q7RTU1 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TCF23Q7RTU1 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TCF23Q7RTU1 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TCF23Q7RTU1 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
TCF23Q7RTU1 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TCF23Q7RTU1 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TCF23Q7RTU1 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TCF23Q7RTU1 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TCF23Q7RTU1 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TCF23Q7RTU1 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TCF23Q7RTU1 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TCF23Q7RTU1 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TCF23Q7RTU1 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TCF23Q7RTU1 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TCF23Q7RTU1 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TCF23Q7RTU1 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TCF23Q7RTU1 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TCF23Q7RTU1 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TCF23Q7RTU1 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TCF23Q7RTU1 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TCF23Q7RTU1 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
TCF23Q7RTU1 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TCF23Q7RTU1 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
TCF23Q7RTU1 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
TCF23Q7RTU1 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TCF23Q7RTU1 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
TCF23Q7RTU1 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TCF23Q7RTU1 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TCF23Q7RTU1 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TCF23Q7RTU1 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TCF23Q7RTU1 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
TCF23Q7RTU1 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
TCF23Q7RTU1 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TCF23Q7RTU1 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TCF23Q7RTU1 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TCF23Q7RTU1 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TCF23Q7RTU1 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TCF23Q7RTU1 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TCF23Q7RTU1 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TCF23Q7RTU1 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TCF23Q7RTU1 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TCF23Q7RTU1 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TCF23Q7RTU1 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TCF23Q7RTU1 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms